二战风云二中海军编组核心为1航母+1-2战列舰+3-5巡洋舰+4-6驱逐舰+2-4潜艇的均衡混编，按先锋、主力、后排、潜伏四层布阵，兼顾视野、火力、防空与反潜，适配全海域作战。
编组先明确舰种定位与数量配比。航母是舰队核心，提供远程视野与舰载机打击，仅需1艘且必须后置保护。战列舰为核心火力，1-2艘即可，负责中远程主炮输出，克制敌方大型舰船。巡洋舰是中坚，3-5艘攻防均衡，补火力、抗伤害，衔接前后排。驱逐舰4-6艘，高机动防空反潜，冲前吸引火力、干扰敌方航母。潜艇2-4艘，潜伏侧翼或深海，偷袭敌方战列舰与航母，规避正面火力。
阵型排布遵循四层梯队逻辑。先锋层由驱逐舰组成，分散前突，探路、防空、反潜，用“猛烈冲击”限制敌方航母机动。主力层为巡洋舰与战列舰，紧凑抱团，巡洋舰护战列舰侧翼，战列舰主打主炮齐射，集中火力破敌阵型。后排层单航母居中后置，远离交火区，持续提供空中支援与视野，避免被集火秒杀。潜伏层潜艇分两队，隐蔽于主力两侧或深海，待敌方主力交火后突袭关键舰船。
资源与科技配套保障编组落地。优先升级造船厂与兵工厂，解锁高级舰船图纸，提升建造效率。科技侧重海军装甲、火炮、鱼雷与舰载机，强化舰队攻防属性。资源重点储备钢铁、石油与橡胶，保障批量建造与补给，前期以驱逐舰、巡洋舰过渡，中期补潜艇，后期成型主力舰队。
实战灵活调整适配不同战场。近海作战减少潜艇，增驱逐舰与巡洋舰，配合岸防火箭炮形成交叉火力。远洋对战强化航母与潜艇，利用舰载机远程消耗，潜艇偷袭破局。对阵纯战列舰编队时，多派驱逐舰绕后干扰，潜艇侧翼突袭，避免正面硬刚。对阵航母编队则优先用驱逐舰防空、潜艇偷袭敌方航母，快速瓦解其空中支援。
