少年三国志2的上阵主角无法被其他武将彻底替换，阵容里主角属于强制出战单位，无法从出战席位中移除。整套出战队伍固定包含一名主角搭配五名自选武将，所有布阵界面都无法把主角更换成仓库内的其他名将，武将置换系统也不会将主角纳入互换范围，即便使用斗转星移石，也只能在普通武将之间转移养成进度，主角始终独立于武将置换机制之外，不会被任何武将顶替出战位置。不少玩家会把性别切换和主角替换混为一谈，角色信息界面支持使用性别转换卡切换男女形象，更换后攻击类型会在物攻与法攻之间切换，适配魏蜀吴群不同阵营体系，但这只是修改基础形象与攻击属性，并没有改变出战单位本身，主角依然要占据固定阵位，不能实现武将替换的核心需求。
想要改变主角的战斗能力，唯一可行的方案是解锁化身系统，等级达标后开启化身玩法，使用对应武将的化身符，主角就能变身成指定三国名将，直接继承该武将的怒气技能、战斗机制与基础属性，仅保留自身的装备、宝物和养成属性。化身分为紫、橙、红、金多个品级，低品质化身可以通过日常任务与常规活动稳定获取，高品质化身需要积攒心愿水晶参与限时兑换。平民玩家优先选择曹丕、文丑这类橙色化身，曹丕能够降低敌方怒气，适配控制流阵容，文丑自带前排续航，适合肉盾站位，氪金玩家可以逐步解锁红色与金色化身，吕布化身主打爆发输出，曹操化身提供群体控场，依靠化身功能，就能让主角拥有不同武将的实战能力，间接弥补无法更换上阵角色带来的阵容短板。
主角的资源投入需要提前规划，它不能像普通武将那样闲置待命，长期占据出战席位，时装、升星、宝物都要同步养成，不然会成为全队战力短板。在阵容调整时，可以灵活调整主角的站位，把化身之后的主角放到四号位或者五号位，搭配其余五名武将组成完整羁绊，援军与助阵位照常激活缘分加成，以此规避主角原生技能偏弱的问题。部分玩家会尝试调整援军配置来规避主角短板，但是援军武将无法替代出战位的主角，只能提供属性增益，想要改变主角的作战方式，依旧要依靠化身图鉴与化身符来完成。激活多套化身图鉴还能解锁全队永久属性加成，即便不使用对应变身，图鉴加成也会持续生效，长期收集各类化身符可以稳步拉高整体队伍战力。
